甲基化敏感擴增多態(tài)性，它是在擴增片段長度多態(tài)性技術的基礎上建立起來的。MSAP技術相對其他測定DNA甲基化程度技術有如下優(yōu)點：

(1)不需知道被測DNA的序列信息，在不同生物上具有通用性，可用于DNA序列背景知識未知的生物。

(2)操作相對簡便，在AFLP技術體系的基礎上不需要太大改進，即可操作。

(3)可在全基因組范圍檢測CCGG位點的胞嘧啶甲基化變化。MSAP技術的局限性在于不能完成非CCGG位點的胞嘧啶甲基化。

MSAP的選擇擴增產物目前主要通過兩種方法進行分離檢測，傳統(tǒng)的聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)的方法和自動化程度較高的毛細管凝膠電泳(FISH)進行檢測。

PAGE方法主要是優(yōu)點是引物可以是普通引物，適用于少量樣本或者大量樣本的引物篩選比較合適，另外還可以對差異條帶進行克隆測序，獲得差異條帶的序列信息。

毛細管電泳檢測方法的優(yōu)點是自動化，可以對大量樣本進行實驗，速度快，后期的條帶讀取可以依靠軟件，降低了人為讀取的標準不一。

1)MSAP服務內容

1 樣本基因組DNA的提取

2 篩選多態(tài)性較好的引物(酶切，預擴，選擇性擴增)

3-1 在ABI3730xl測序儀上完成數據采集

3-2 或是在JY-CX2B型 測序電泳槽上完成PAGE 檢測(可以回收差異帶)

數據分析：和客戶詳細溝通，確認分析方案：讀取01矩陣，PAGE膠建議客戶自己讀取;

2)客戶提供：

★ 基因組DNA：

●至少15μL樣品，濃度為50-100ng/μL;

●2%瓊脂糖電泳檢測有DNA主帶，沒有降解;

●DNA經過DNA純化試劑盒或磁珠純化;

●DNA需溶解在TE或滅菌的去離子水里;

●DNA溶解后，肉眼看不到雜色;

★ 植物材料： 新鮮組織，葉片采用硅膠干燥后或干冰運輸;

★ 動物材料： 新鮮組織，無水乙醇封存低溫運輸;

3)試驗費用：