甲基化敏感擴(kuò)增多態(tài)性，它是在擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性技術(shù)的基礎(chǔ)上建立起來(lái)的。MSAP技術(shù)相對(duì)其他測(cè)定DNA甲基化程度技術(shù)有如下優(yōu)點(diǎn)：

(1)不需知道被測(cè)DNA的序列信息，在不同生物上具有通用性，可用于DNA序列背景知識(shí)未知的生物。

(2)操作相對(duì)簡(jiǎn)便，在AFLP技術(shù)體系的基礎(chǔ)上不需要太大改進(jìn)，即可操作。

(3)可在全基因組范圍檢測(cè)CCGG位點(diǎn)的胞嘧啶甲基化變化。MSAP技術(shù)的局限性在于不能完成非CCGG位點(diǎn)的胞嘧啶甲基化。

MSAP的選擇擴(kuò)增產(chǎn)物目前主要通過(guò)兩種方法進(jìn)行分離檢測(cè)，傳統(tǒng)的聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)的方法和自動(dòng)化程度較高的毛細(xì)管凝膠電泳(FISH)進(jìn)行檢測(cè)。

PAGE方法主要是優(yōu)點(diǎn)是引物可以是普通引物，適用于少量樣本或者大量樣本的引物篩選比較合適，另外還可以對(duì)差異條帶進(jìn)行克隆測(cè)序，獲得差異條帶的序列信息。

毛細(xì)管電泳檢測(cè)方法的優(yōu)點(diǎn)是自動(dòng)化，可以對(duì)大量樣本進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，速度快，后期的條帶讀取可以依靠軟件，降低了人為讀取的標(biāo)準(zhǔn)不一。

1)MSAP服務(wù)內(nèi)容

1 樣本基因組DNA的提取

2 篩選多態(tài)性較好的引物(酶切，預(yù)擴(kuò)，選擇性擴(kuò)增)

3-1 在ABI3730xl測(cè)序儀上完成數(shù)據(jù)采集

3-2 或是在JY-CX2B型 測(cè)序電泳槽上完成PAGE 檢測(cè)(可以回收差異帶)

數(shù)據(jù)分析：和客戶詳細(xì)溝通，確認(rèn)分析方案：讀取01矩陣，PAGE膠建議客戶自己讀取;

2)客戶提供：

★ 基因組DNA：

●至少15μL樣品，濃度為50-100ng/μL;

●2%瓊脂糖電泳檢測(cè)有DNA主帶，沒(méi)有降解;

●DNA經(jīng)過(guò)DNA純化試劑盒或磁珠純化;

●DNA需溶解在TE或滅菌的去離子水里;

●DNA溶解后，肉眼看不到雜色;

★ 植物材料： 新鮮組織，葉片采用硅膠干燥后或干冰運(yùn)輸;

★ 動(dòng)物材料： 新鮮組織，無(wú)水乙醇封存低溫運(yùn)輸;

3)試驗(yàn)費(fèi)用：